Kemudian, ia menjadi pelatih PS Sumbawa Barat (2016-2017), PSPS Riau (2017-2018), dan terakhir Persiraja Banda Aceh (2019-2021). Dia pelatih yang berhasil membawa Persiraja naik level ke Liga 1 musim 2020 dari sebelumnya di Liga 2.

Terakhir musim kompetisi Liga 2 2023/2024 ini, Hendri Susilo sempat menjadi pelatih PSBS Biak.
yang pernah menyelamatkan Semen Padang FC dari degradasi menggantikan Coach Weliansyah 2021 lalu.

Hendri Susilo harus mengakhiri kerjasamanya dengan Semen Padang FC setelah 3 kali kalah dari 4 laga yang lakoni di musim kompetisi Liga 1 2024/25 lalu.